550萬(wàn)個(gè)灰棗接穗的品種純度進(jìn)行鑒定
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新疆農(nóng)林業(yè)司法鑒定所司法鑒定檢驗(yàn)報(bào)告書
新農(nóng)林檢字[2008]第0321號(hào)
一、基本情況
委托單位:新和縣塔木托格拉克鄉(xiāng)人民政府
委托鑒定事項(xiàng):對(duì)新和縣塔木托格拉克鄉(xiāng)所采購(gòu)的550萬(wàn)個(gè)灰棗接穗的品種純度進(jìn)行鑒定。
受理日期:2008年3月21日
鑒定材料:棗樹接穗
鑒定日期:2008年3月21日
鑒定地點(diǎn):新和縣新疆惠華食品有限公司6號(hào)冷庫(kù)
在場(chǎng)人員:朱永剛、劉國(guó)權(quán)、阿地力阿吾提、海仁沙,張長(zhǎng)江、任生理。
二、檢案摘要
新和縣塔木托格拉克鄉(xiāng)人民政府采購(gòu)了550萬(wàn)個(gè)灰棗接穗,為查清該批灰棗接穗的純度,特委托我所對(duì)550萬(wàn)個(gè)灰棗接穗的品種純度進(jìn)行鑒定。
三、檢驗(yàn)過(guò)程
我所接受委托后,于2008年3月21日指派鑒定人員張長(zhǎng)江、任生理二人組成鑒定組,到達(dá)新和縣新疆惠華食品有限公司6號(hào)冷庫(kù),提取了棗樹接穗樣品:
(一)、所取樣品的抽樣基數(shù)為550萬(wàn)個(gè)灰棗接穗(分裝在522個(gè)塑料袋內(nèi))。
(二)、檢驗(yàn)方法及過(guò)程:
1、DNA模板的制備
提取程序參照Paterson所述的CTAB法。
(1)取3g接穗枝皮,在液氮冷凍下迅速研磨成粉末,放入50mL離心管中,加入15mL裂解緩沖液(65℃),混勻,65℃水浴30~60mim
(2)水浴后加入等體積的氯仿-異戊醇(24:1),16℃,5000r/min,離心10min。
(3)吸取上清液加入等體積氯仿-異戊醇(24:1),4℃,5000r/min,離心10min。
(4)吸取上清液加入0.6倍體積的冰凍異戊醇,沉淀DNA。
(5)DNA用70%乙醇侵洗2~3次。室溫干燥后,容于700μL 1×TE中。
(6)加入15μLRNaseA,37℃水浴保溫1h。
(7)加入等體積的酚-氯仿溶液,10000r/min 4℃ 離心10min。
(8)吸取上清液加等體積的氯仿-異戊醇(24:1),10000r/min 4℃ 離心10min。
(9)吸取上清液加等體積的水飽和乙醚和1/3體積的5M NaCl,10000r/min 4℃ 離心10min。
(10)吸取上清液,加入1/10體積3M醋酸鈉,2倍體積的無(wú)水乙醇。靜止2~5min,挑DNA,風(fēng)干,加100μL 1×TE溶解。-20℃下保存?zhèn)溆谩?/p>
(12)用紫外分光光度計(jì)測(cè)定DNA樣品的質(zhì)量和濃度。根據(jù)測(cè)定數(shù)值,稀釋DNA至試驗(yàn)需要濃度。
2 AFLP擴(kuò)增與產(chǎn)物檢測(cè)(以下過(guò)程均在德國(guó)Biometra公司生產(chǎn)的T Gradient PCR儀中進(jìn)行)
2.1 AFLP擴(kuò)增體系及擴(kuò)增程序
(1)模板DNA的酶切體系及條件
成分??????????????????????????????????????????體積
DNA(150ng/μL)????????????????????????????? 3μL
H2O?????????????????????????????????????????? 14.3μL
10×NEB Buffer??????????????????????????????? 2μL
100×BSA?????????????? ???????????????????????0.2μL
Mse I(15U/μL)????????????????????????????? 0.2μL
EcoR I(10/μL)????????????????????????????? 0.3μL
總體積20μL/管
酶切溫度37℃,時(shí)間3h。
(2)酶切DNA片斷的連接體系及條件
DNA在酶切后加入以下成分,總體積30μL/管。37℃下過(guò)夜,連接結(jié)束后65℃變性10min。
成分??????????????????????????????????? ??????體積
H2O??????????????????????????????????????????? 2.7μL
10×T4 Buffer????????????????????????????????? 3μL
EcoR I接頭(5p mole/μL)???????????????????? 1.0μL
Mse I接頭(50p mole/μL)???????????????????? 1.0μL
10mM?ATP?????????????????????????????????????? 1.8μL
T4-DNA連接酶(3U/μL)??????????????????????? 0.5μL
(3)連接產(chǎn)物的預(yù)擴(kuò)增體系和擴(kuò)增程序
將連接產(chǎn)物用0.1×TE稀釋10倍用于預(yù)擴(kuò)增。
成分??????????????????????????????????????????體積
連接稀釋DNA?????????????????????????????????? 5μL
H2O??????????????????????????????????????????? 10.1μL
10×PCR Buffer??? ?????????????????????????????2μL
2.5mM?dNTP???????????????????????????????????? 1.6μL
Mse I引物(M00,50ng/μL)??????????????????? 0.6μL
EcoR I引物(M00,50ng/μL)?????????????????? 0.6μL
Taq酶(5U/μL)?????????????????????????????? 0.1μL
礦物油?????????????????????????? ??????????????8μL
預(yù)擴(kuò)增程序:
Step1?????????????????????95℃????????????????? 2min
Step2?????????????????????95℃????????????????? 30s
Step3?????????????????????56℃????????????????? 30s
Step4?????????????????????72℃????????????????? 60s
Step5????????????????? GO TO Step2????????????? 30 cycle
Step6?????????????????????72℃????????????????? 10min
Step7?????????????????????10℃????????????????? 10h
(4)DNA片斷的選擇擴(kuò)增和擴(kuò)增程序
將預(yù)擴(kuò)增產(chǎn)物用0.1×TE稀釋10倍用于預(yù)擴(kuò)增。
成分??????????????????????????????????????????體積
預(yù)擴(kuò)稀釋DNA?????????????????????? ????????????5μL
H2O??????????????????????????????????????????? 9.85μL
10×PCR Buffer???????????????????????????????? 2μL
2.5mM?dNTP???????????????????????????????????? 1.8μL
Mse I引物(50ng/μL)???????????????????????? 0.6μL
EcoR I引物(50ng/μL)?????????????????? ?????0.6μL
Taq酶(5U/μL)?????????????????????????????? 0.15μL
礦物油???????????????????????????????????????? 8μL
選擇擴(kuò)增程序:
Step1?????????????????????95℃????????????????? 2min
Step2?????????????????????95℃????????????????? 50s
Step3?????????????????????65℃??????? ??????????40s(每循環(huán)降低1℃)
Step4?????????????????????72℃????????????????? 60s
Step5????????????????? GO TO Step2????????????? 13 cycle
Step6?????????????????????95℃????????????????? 50s
Step7?????????????????????56℃????????????????? 40s
Step8????????????????? ???72℃????????????????? 60s
Step9????????????????? GO TO Step6????????????? 31 cycle
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